計算機動畫在醫學教育方面也有著廣闊的應用前景。有些基本概念、原理和方法需要給學生以感性上的認識，在實際教學中有可能無法用實物來演示，這時可以借助于計算機三維醫學手術動畫把各種表面現象和實際內容進行直觀演示和形象教學，大到宇宙形成，小到基因結構，無論是化學反應還是物理定律，使用計算機醫學演示動畫都可以淋漓盡致地表示出來。